產(chǎn)品介紹
基于液相雜交捕獲技術(shù),結(jié)合亞硫酸鹽處理(DNA甲基化檢測(cè)金標(biāo)準(zhǔn)),實(shí)現(xiàn)單堿基分辨率分析。探針設(shè)計(jì)覆蓋關(guān)鍵甲基化調(diào)控區(qū)域:CpG島、啟動(dòng)子、差異性甲基化區(qū)域(DMRs)、CpG島上下游2kb的“shores”及“shelves”區(qū)域。
核心性能
覆蓋范圍:
人基因組設(shè)計(jì)長(zhǎng)度84 Mb,覆蓋 370萬(wàn) CpG位點(diǎn),包含與癌癥、精神疾病等相關(guān)的表觀遺傳區(qū)域。
支持物種:人、小鼠(109 Mb)、大鼠(97 Mb)。
靈敏度與成本:
相比全基因組亞硫酸鹽測(cè)序(WGBS),通量提高30%,成本降低50%。
可檢測(cè)傳統(tǒng)方法(如限制性內(nèi)切酶、免疫沉淀)無(wú)法覆蓋的甲基化區(qū)域。
探針優(yōu)勢(shì):
探針不依賴甲基化狀態(tài),避免抗體或酶法偏好性偏差
實(shí)驗(yàn)流程
樣本類型 | 建議送樣量 | 保存、運(yùn)輸介質(zhì) |
組織 | >100mg | -80℃保存,干冰運(yùn)輸 |
細(xì)胞 | >4 x 10^6 | -80℃保存,干冰運(yùn)輸 |
血液 | >1ml | -80℃保存,干冰/4度(新鮮)運(yùn)輸 |
FFPE | A.切片組織面積大于1cm2,切片表面無(wú)劃痕,無(wú)干裂,均勻貼片的石蠟切片; B.切片組織細(xì)胞>30000個(gè);有核細(xì)胞比例>80%;腫瘤細(xì)胞比例>20%,白片厚度5~ 10um,需3-5片,組織面積偏小或細(xì)胞核占比未達(dá)80%以上,需提供5-12片; C.石蠟塊:厚度4mm以上,組織約綠豆大小以上; D.蠟卷:厚度25um左右,2-5卷 | 4℃或常溫保存和運(yùn)輸 |
gDNA | >2ug | -80℃保存,干冰運(yùn)輸 |